为提高南阳市对外开放水平，打造外向型经济发展平台，南阳市委，市政府在2012年3月启动南阳卧龙综合保税区申建工作。通过不懈努力，国务院于2014年11月16日正式批准设立南阳卧龙综合保税区，成为我省继新郑后的第二家综合保税区。
南阳卧龙综合保税区规划总面积3.03平方公里，一期建设区1.05平方公里，位于南阳市中心城区西北部卧龙区内的光电产业集聚区。该产业集聚区是一家以光电作为主导产业的产业集聚区，已经入驻富士康投影机和LED灯具、荣阳实业CNC精加工、示佳光电等一批光电及光电配套企业。
根据省政府提出的要求，卧龙综合保税区建设起点要高，视野要开阔，建成河南省高端开放平台、郑州航空港综合实验区的延展区、中烟经济区快速发展的助推器和中部地区崛起的增长极。要立足南阳光电、装备制造等优势产业，进一步明晰产业定位，有针对性地进行产业链招商，着力培育新型产业。在建设上要做到基础设施建设与口岸通关设施建设同步、综保区建设与项目建设同步，确保12月初具备封关运行条件，迎接国家相关部委验收。
按照高起点、高质量编制规划设计的要求，选定了著名的清华同衡规划设计院有限公司进行卧龙综合保税区规划设计工作。规划设计方案中对卧龙综合保税区的发展定位是连接东部沿海与内陆腹地的中专枢纽和国际经济合作平台、新型内陆开放高地，形成以电子信息和装备制造业为特色，以区域保税物流为支撑，以研发、展示交易、检测维修为延伸的内陆特色依托型综合保税区。
功能定位是以保税加工为主，保税物流和保税服务为辅的"一核三板块".
产业选择原则是符合海关特殊监管区域人区项目指引，以及综合保税区未来产业产务导向，具备产业基础较好、能够较快形成集聚的比较优势和产业链较长、能够带动周边区域的带动能力。具体包括电子信息、光电、装备制造和其他特色高新技术加工环节等保税加工工业；出口集拼型、进口配型型、简单加工型、国内结构型、物流综合型的高附加值保税物流业；生产性、流动性以及跨境电子商务、融资租赁等保税服务业。
