福田保税区建有一号专用通道，经落马洲大桥直通香港，实际投资200万港元以上的外资企业可办理特殊行驶标志。有特殊行驶标志的香港货柜车可自由进出保税区，有特殊行驶标志的香港私家车可经一号通道到保税区并在深圳市内行使。另建有二号通道、三号桥与深圳市区相连，并已开通公共巴士。致力于发展高科技工业和现代物流业。如今已有22个国家和地区的投资者在福田保税区内投资，产品主要为微电子、电脑及零配件、光通讯元器件、生物医药工程等。
福田保税区内建有供8000人就餐的配餐中心和大型的会议厅，商务配套设施齐全。配套区、生活区内建有员工宿舍，另商品住宅、酒店、餐厅、银行、学校、医疗机构等设施等一应俱全。
20多年来，依托毗邻香港的区位优势和先行先试的体制机制优势，充分发挥了福田保税区作为国家对外开放窗口的示范作用，是国内发展成就比较突出和极具竞争力的保税区域之一。
从境外运入保税区或从保税区运往境外的货物，免关税和进口环节增值税，除实行出口被动配额管理的外，不实施进出口配额和许可证管理；
海关对保税区内企业所进口的生产性基础设施项目所需机器、设备和其他基建物资，免进口关税和进口环节增值税；
海关对保税区内企业所进口的自用的生产、管理设备和自用合理数量的办公用品及其所需的维修零配件，生产用燃料，建设生产厂房、仓储设备所需的物资、设备，免进口关税和进口环节增值税；
国内货物（含三资企业产成品）进入保税区视同出口，但货物实际离境方可办理退税。
