六横功能区的功能定位是现代化临港产业岛，重点发展高端特种船舶、港口物流、大宗商品加工等临港产业和海水淡化、深水远程补给装备、海洋新能源等海洋新兴产业。结合《六横岛总体发展规划》，我们重点打造北部、东北部、南部、西南部（小郭巨区块）、佛渡五大发展区块作为功能区产业发展的载体。
北部发展区：规划面积8平方公里，海岸线总长10.7公里，可用土地约4.5平方公里，后方规划设置船舶配件产业园，目前已布局中远、鑫亚、龙山、东鹏、燃料乙醇、船舶配件等工业企业。
东北部发展区：规划面积10平方公里，海岸线长12公里，可用土地面积9.3平方公里，可用岸线长9公里，主要布局大型物流中转及能源项目。目前已布局浙能煤炭中转码头、六横电厂等项目，尚预留双塘9.3平方公里、5400米的岸线作为集装箱码头及物流区块。同时，探索利用六横电厂循环冷却水余热、海水淡化产生的浓海水，发展工业和旅游有机结合的“舟山死海”综合水上娱乐项目。
南部发展区：规划面积约29.7平方公里，海岸线长36.8公里，拥有丰富的海洋旅游资源，规划为海洋休闲旅游区。该区块重点集聚人气，完善配套基础设施，提升城市宜居水平，目前已布局有海岛世界旅游度假区、假日岛等项目。
西南部发展区：主要依托小郭巨围垦区，总规划可用面积37.65平方公里，其中小郭巨一期8平方公里围垦工程已经完工；二期围垦工程15.1平方公里；农村居民点用地0.76平方公里，其余为农田、池塘和山林。可建10-30万吨级泊位岸线为3.5公里，可建10万吨级以下泊位岸线约7公里。根据编制中的《六横岛产业发展规划》，该区域作为六横最具发展潜力的增长空间，按照大平台、大产业、大项目、大企业的“四大”原则，初步考虑在该区域布局钢铁、临港大型装备制造（如海洋能装备制造）、战略物资储运等3-4个重特大临港产业项目，并引进与之相配套的关联企业，力争年产值达到1000亿元。同时，将服务设施与峧头城区对接，形成港城相及、产城联动的发展格局。
佛渡发展区：佛渡岛位于六横本岛西北侧，与本岛之间仅隔双屿国际水道，距国家级保税港区—梅山仅3.15公里，区域规划可用面积7.85平方公里，可围垦面积3平方公里，可用等深线在-25米以上的深水岸线约10公里。该区域为预留发展区块，目前无项目入驻。
