国务院以国函〔2016〕92号文件正式批复山东省人民政府和海关总署，同意威海出口加工区整合优化为威海综合保税区，这是全国第45个综合保税区。
威海综合保税区规划面积2.29 平方公里，共2个区块。区块一为经区原威海出口加工区已封关区域，规划面积0.92 平方公里，四至范围：东至海埠路、南至荣成路、西至香港路、北至凤林村；区块二为新设区域，位于文登区威海空港附近，规划面积1.37 平方公里，四至范围：东至威石路、南至309国道、西至机场路、北至大水泊南河。
设立威海综合保税区是威海市委市政府为增强全市开放型经济新优势而推进的一项重大举措。一是威海综合保税区将享受系列优惠政策，包括：境外货物入区保税或免税；货物出区进入境内区外销售按进口货物的有关规定办理报关手续，并按货物实际状态征税；境内区外货物入区视同出口，实行退税；区内企业之间的货物交易免征增值税和消费税。二是有利于促进土地等资源要素向综保区集聚，提高园区产业聚集度和节约集约发展水平，加快推进全市重点区域和市域一体化建设。三是更加有利于发挥政策叠加优势，加快发展保税加工、保税物流、保税服务、虚拟口岸等功能，同中韩自贸区地方经济合作示范区建设、服务贸易创新发展试点互相促进、共同提升。
获批后，威海综合保税区经区片区将积极做优做强出口加工业务，加快发展保税物流业务和跨境电子商务，打造高端信息产业基地和仓储物流中转基地；进一步调整完善区域功能，推动单一加工贸易区域向综合功能区域转变，全力做大保税物流，不断增强中心平台效应和辐射力。文登片区将重点发展保税物流、保税加工、国际贸易、国际配送四大功能，突出商贸物流功能，以大物流带动大发展，促进园区与周边空港、海港间“区港联动”，建设综保区大物流园；同时，探索发展服务贸易，建设产品研发、检测、维修中心，引进符合产业发展规划的高附加值项目。
综合保税区是目前我国境内开放层次最高、优惠政策最多、功能最齐全的海关特殊监管区域，是国家开放金融、贸易、投资、服务、运输等领域的试验区和先行区。威海市将立足对韩国、日本的区位优势和产业合作优势，努力将威海综合保税区打造成为全国一流的综合保税区，为威海乃至山东开放型经济发展作出更大贡献。
